Film Eyang Kubur menceritakan tentang tiga pemuda yang hidupnya penuh dengan kenakalan dan malas beribadah. Mereka adalah Damar, Radit, dan Heru. Suatu hari, mereka ditantang oleh teman-temannya untuk menguji nyali di sebuah kuburan angker yang dikenal sebagai tempat bersemayamnya arwah seorang eyang (kakek tua) yang dulunya sakti dan menyeramkan.
Mereka menerima tantangan tersebut dan memutuskan untuk bermalam di kuburan itu. Awalnya, semua terasa seperti lelucon. Namun malam itu berubah menjadi pengalaman mencekam ketika arwah Eyang yang sudah lama menghuni kuburan tersebut mulai menampakkan diri. Arwah tersebut ternyata tidak hanya menakutkan, tapi juga ingin memberikan pelajaran moral kepada para pemuda nakal ini agar mereka bertobat dan kembali ke jalan yang benar.
Melalui teror dan kejadian supranatural yang dibumbui humor, film ini menyampaikan pesan tentang pentingnya menjalani hidup dengan lebih baik dan religius.