Une jeune femme amnésique est retrouvée nue, sortant d'un sac, en plein Time Square à New York. Son corps est recouvert de tatouages mystérieux fraîchement réalisés. Kurt Weller, un agent du FBI, est chargé de l'enquête avec son équipe. Il suit les indices des symboles cabalistiques inscrits sur le corps de cette femme dont la vie d'avant s'est envolée. Surnommée Jane Doe par les enquêteurs, elle apparaît comme surentraînée, une vraie tueuse, dont le passé ressurgit par bribes. Les symboles sur son corps révèlent une conspiration de grande ampleur. A elle seule, Jane Doe semble être un véritable moteur de recherches que les cryptologues aimeraient comprendre. Mais peut-on faire confiance à ces tatouages?