Pour battre "Contrôle", l'ordinateur fou qui menaçait d'anéantir l'univers, Burnham a dû prendre une décision qui l'a projetée 930 ans dans le futur. Elle découvre avec horreur que la Fédération a été complètement anéantie 119 ans plus tôt dans une catastrophe appelée le "Brasier". Lors du Brasier, tous les vaisseaux spatiaux utilisant du dilithium on été détruits par l'explosion de leur carburant : soit la quasi-totalité des engins spatiaux, dont ceux de Starfleet. Burnham fait subir au Discovery le même bond temporel qu'elle. Elle espère ainsi regrouper les débris de la Fédération, car de nouvelles menaces pèsent sur l'univers. Grâce au twist scénaristique du voyage dans le temps, cette troisième saison s'écarte de la chronologie canonique de la franchise.