Shaun Murphy a passé beaucoup de temps à soigner Glassman, atteint d'un cancer. Il a pour cela risqué sa place, qu'il a un temps perdue, puis retrouvée. Aujourd'hui, il semble que la situation soit apaisée. Shaun occupe son poste au sein de l'hôpital sans se sentir menacé. Le docteur Han a été renvoyé. L'esprit dégagé de ces principaux soucis, Shaun s'est rapproché de Carly. Tous deux sont sortis ensemble. Longtemps resté solitaire, Shaun paraît vouloir mener une vie sociale plus épanouie. Le casting de cette troisième saison reprend la distribution principale du show, sans Daniel Dae Kim (Jackson Han) en temps que personnage récurrent. Kim reste néanmoins coproducteur de la série.
