Mad Father ist ein klassisches Horror-Spiel im pixiligem Anime-Look. Die elfjährige Protagonistin Aya macht am Todestag ihrer Mutter eine schokierende Entdeckung: Ayas Vater hat vor sie zu einer seiner Puppen zu machen! Während sie versucht ihrem Vater zu entkommen und aus dem Haus zu flüchten, begegnet sie mehreren Opfern und Versuchsobjekten ihres Vaters...