Après avoir échoué à rejoindre l'équipe des Avengers, Wade Wilson mène une existence paisible, continuant de chercher sa voie en enchaînant les petits boulots. Mais il est bientôt rattrapé par son trouble passé. En effet, l'agent Paradox, un haut gradé du Tribunal des variations anachroniques dont la mission consiste à surveiller les différentes réalités du multivers, lui propose de rejoindre les rangs de son organisation. Wade ne tarde pas à découvrir que cette alléchante proposition cache une terrible réalité : son monde et tous ceux qu'il aime seront anéantis. Après avoir décliné l'offre, Wade revêt son costume de Deadpool et tente de convaincre Wolverine de l'aider à sauver son univers...