Claire und Jeanne sind Zwillingsschwestern, die eine Passion teilen: Klavierspielen. Von ihrem Vater werden die beiden mit rauen Methoden zu Bestleistungen angetrieben. Doch dann schlägt das Schicksal zu. Beide Schwestern entwickeln eine Krankheit, die sie in ihrer Motorik einschränkt und bald können sie nicht mehr auf herkömmliche Art und Weise Klavier spielen. Der Vater ist verzweifelt und gibt seine Töchter auf, doch in Prodigies ist die Liebe der Frauen zur Musik stärker als jeder Schicksalsschlag.