Depuis cinq ans, Briksburg vit dans une atmosphère post-apocalyptique. D'ailleurs, Lucy se morfond. C'est alors que des envahisseurs Duplo, tout droit venus de l'espace, viennent perturber ce bel équilibre. Sur leur passage, ils enlèvent Lucy. Emmet est bien décidé à la sauver des aliens. Pour cela, il se construit un vaisseau afin de se rendre aux confins de la galaxie. En chemin, il est sauvé par Rex Dangervest, un baroudeur, archéologue, cow-boy et dresseur de raptors. Entretemps, Lucy et ses amis Batman et consorts, font la connaissance d'une reine redoutable capable de changer d'apparence...