لم تتضح بعد الأسباب النهائية وراء عملية الاغتيال، إلا أن الشرطة اليابانية قالت إن المشتبه به اعترف بارتكاب الجريمة، وقال إنه كان حاقداً على آبي لأنه كان يعتقد أن رئيس الوزراء السابق مرتبط بـ"منظمة معينة".