Le protocole sanitaire repose sur cinq piliers. D'abord, le maintien de la distance physique.
Toutes les personnes présentes dans les écoles devront respecter une distance minimale d'un mètre à tous les moments de la vie scolaire. Dans les salles de classe, seuls quinze élèves seront donc accueillis. Un sens de circulation, avec un marquage au sol pourra être mis en place.
Autre point : limiter le brassage des élèves. Pour qu'ils se croisent le moins possible, les arrivées devront être échelonnées sur le début de matinée. Les heures de pauses déjeuner et de récréation seront prises à des horaires décalés et, au collège, une salle devra être assignée à chaque classe.