في الوقت الذي احتفل فيه فلسطينيو غزة بالعملية التي نفذها مقدسيان في معبد يهودي في القدس المحتلة، اندلعت اشتباكات بين الشباب الفلسطيني وقوات الأمن الإسرائيلية في حي جبل المُكَرِّم في القدس الشرقية حيث تواجهت خلالها الحجارة مع القنابل المسيلة للدموع والرصاص المطاطي، لا سيما في لحظة قدوم قوات الاحتلال إلى الحيِّ لاعتقال أفراد من عائلتيْ منفذيْ الهجوم على الكنيس.
وقد اعترفت الشرطة الإسرائيلية باعتقالها تسعة فلسطينيين.
سلطات الاحتلال، أمرت بتسريع تهديم مساكن ذوي منفذيْ عملية القدس.

الاشتباكات انتقلت إلى الضفة الغربية بعد وقوع عملية القدس لتزيد الوضع توترا في هذه المنطقة التي تعيش منذ أسابيع غليانا حادان لا سيما منذ بداية محاولات اقتحام مستوطنين إسرائيليين باحة المسجد الاقصى وإحراق مسجد في نابلس خلال الايام الأخيرة ثم عملية شنق فلسطيني مقدسي أمس الاثنين داخل الحافلة التي كان يعمل سائقا فيها.